Диагностика основана на измерении отношения13С выдыхаемого воздуха после принятия определенного субстрата , обогащенного устойчивым изотопом 13С на ИК анализаторе. 13С- дыхательный тест является «золотым стандартом» определения инфекции Helicobacter pylori, т.к. данный метод диагностики является высоко чувствительным, при помощи него можно определить наличие бактерий, даже если нет явных симптомов их присутствия. Кроме того, это наиболее приятный метод диагностики , т.к. от пациента необходим только выдыхаемый воздух и не требуется проглатывание эндоскопа(что очень болезненно переносится пациентами).